Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3rP40223 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csf3rP40223 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms