Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp12P34960 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms