Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms