Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnd3P30282 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd3P30282 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms