Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtgfP29268 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms