Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms