Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja4P28235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja4P28235 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja4P28235 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja4P28235 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja4P28235 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja4P28235 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja4P28235 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms