Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms