Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms