Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms