Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SftpcP21841 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SftpcP21841 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SftpcP21841 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpcP21841 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpcP21841 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SftpcP21841 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SftpcP21841 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpcP21841 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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