Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms