Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms