Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifrd1P19182 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms