Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd48P18181 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd48P18181 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd48P18181 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms