Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb1P17919 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms