Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms