Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolP11369 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolP11369 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolP11369 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolP11369 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PolP11369 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PolP11369 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PolP11369 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms