Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms