Protein–RNA interactions for Protein: P0C673

Igsf11, Immunoglobulin superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf11P0C673 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf11P0C673 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf11P0C673 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms