Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb2P0C1T1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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