Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms