Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa9P09631 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms