Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms