Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms