Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnfP06804 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnfP06804 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnfP06804 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnfP06804 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnfP06804 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnfP06804 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnfP06804 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnfP06804 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TnfP06804 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms