Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms