Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-Ab1P01921 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms