Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms