Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01747 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01747 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01747 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01747 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01747 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01747 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms