Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01735 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01735 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01735 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01735 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01735 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01735 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01735 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms