Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01663 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01663 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01663 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01663 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01663 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01663 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01663 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01663 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01663 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms