Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp9O88851 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp9O88851 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms