Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JtbO88824 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
JtbO88824 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JtbO88824 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JtbO88824 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JtbO88824 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms