Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt1O88346 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt1O88346 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms