Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma3O70435 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psma3O70435 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms