Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx4O55187 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms