Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms