Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn20O55082 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms