Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlkO54988 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SlkO54988 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlkO54988 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlkO54988 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlkO54988 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms