Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms