Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarce1O54941 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms