Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edil3O35474 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edil3O35474 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms