Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms