Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna6O35345 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Kpna6O35345 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna6O35345 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms