Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms