Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Ptpn9O35239 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn9O35239 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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