Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RrhO35214 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RrhO35214 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RrhO35214 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RrhO35214 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RrhO35214 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RrhO35214 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RrhO35214 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RrhO35214 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RrhO35214 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RrhO35214 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RrhO35214 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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