Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih2O35089 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms