Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn4O35054 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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